1.生物測定法
生物測定法利用特定生物對相應農藥化合物的特定生化反應來判斷農藥殘留及其污染情況，無需對樣品進行前處理或前處理比較簡單快速，但對供試生物要求較高，可能出現假陽性或假陰性，并且不能確定農藥品種。
2.理化分析法
理化分析法又分為儀器檢測法、常規化學分析法及快速檢測法等，目前Z常用的是儀器檢測法，如氣相色譜法和液相色譜法。由于農藥種類繁多，而農藥殘留污染檢測屬于痕量化學分析，要求較高的技術條件。
2. 農產品農藥殘留檢測步驟
農藥殘留檢測步驟主要包括采樣、樣品保藏、前處理(粉碎、提取/萃取、凈化、濃縮等)、儀器定性定量分析、檢測結果處理及分析等。在農藥殘留檢測中前處理相當重要。下面著重說明一下前處理。
1.樣品均質
在檢測農產品的某些指標時，由于物料不是均質的，各部位的成分及污染的程度不同，把樣品破碎混勻成均質液，才能進行檢測。如何將蔬菜、水果這類農產品均質?我們可以采用拍擊式均質器將蔬菜、水果等農產品和稀釋液加入到無菌的過濾器樣品袋中 ，然后將樣品袋放入均質器中，關上門即可以完成均質，根據需要，配制所需濃度，采用相應的分析儀器進行測定。
2.濃縮凈化
我們知道農藥殘留污染檢測屬于痕量化學分析，正確選擇試驗儀器可以起到事半功倍的作用。使用固相萃取裝置和液液萃取裝置(加入萃取劑，采用垂直振蕩器就可以，這樣大大減少了勞動強度)萃取樣品中的目標物質;使用氮吹儀濃縮樣品中的目標物質。